Faire avancer la recherche sur le microbiome et les probiotiques

À l’occasion de la Journée mondiale du microbiome, célébrons les actions multiples et novatrices de notre groupe de recherche et développement, composé de plus de 40 membres et dirigé par Sylvie Binda, qui font progresser la recherche sur le microbiome et les probiotiques au service de la santé humaine.

Contribuer aux efforts d’intelligence collective

Nous collaborons avec des institutions de recherche de premier plan, des universités, des leaders d’opinion et des experts de l’industrie, et participons à des discussions scientifiques et réglementaires pour repousser les limites de la science du microbiome et des découvertes translationnelles. Nos positions clés au sein d’associations renommées incluent l’European Microbiome Innovation for Health (anciennement connue sous le nom d’Alliance Promotion Microbiome-APM), le Human Microbiome Action Project (HMA), et le projet French Gut.

Enquête sur le microbiome dans tous les essais cliniques

L’échantillonnage du microbiote est systématiquement inclus dans chaque étude clinique afin de mieux comprendre les interactions entre l’hôte et les microbes. L’équipe de notre laboratoire de recherche interne a développé et standardisé un pipeline d’analyse du microbiome. Ce pipeline couvre l’acquisition et le traitement de différents types d’échantillons, représentant plusieurs microbiotes humains (oral, cutané, vaginal, lait maternel et fécal, y compris le méconium). La collecte des métadonnées des échantillons, ainsi que les données de séquençage et l’analyse bioinformatique, fournissent des détails qualitatifs sur l’écologie du microbiote à différents endroits du corps humain, mais aussi une compréhension essentielle des interactions métaboliques microbiennes afin d’obtenir des informations mécanistiques grâce à l’intégration d’approches multi-omiques. Les progrès de la science du microbiome soulèvent également la question difficile de savoir si l’on peut aller encore plus loin dans l’exploration de l’intérieur du corps humain. Cela s’applique en particulier à l’intestin grêle, ce territoire inexploré, qui abrite des bactéries spécifiques, est un environnement dynamique qui diffère de celui du côlon et qui joue probablement des rôles importants au-delà de la digestion. Ces questions intrigantes, à savoir comment les différents microbes de l’intestin grêle modulent la fonction gastro-intestinale et comment les probiotiques peuvent jouer un rôle dans cette niche, nous ont amenés à développer une collaboration passionnante avec Nimble Science. Nous avons utilisé une nouvelle méthode d’échantillonnage appelée capsule SIMBA(TM)  (Small Intestine MicroBiome Aspiration) pour un échantillonnage pratique, non invasif, de haute qualité et fiable afin d’étudier les interactions entre l’alimentation et le microbiote dans l’intestin grêle. Avec Nimble Science, nous avons récemment publié une étude clinique de preuve de concept validant l’efficacité de la capsule pour détecter les interventions de souches probiotiques dans l’intestin grêle, ce qui n’était pas possible avec des échantillons de selles. Cette capsule de haute précision est susceptible de devenir un outil de recherche inestimable dans les essais cliniques pour étudier les interactions du microbiote probiotique dans la santé et la maladie, et peut-être un jour pour le diagnostic clinique des conditions du tractus gastro-intestinal affectant l’intestin grêle, telles que la prolifération bactérienne dans l’intestin grêle (SIBO).

Développement de la prochaine génération de probiotiques

Notre programme innovant sur le microbiome se concentre également sur le développement de probiotiques de nouvelle génération et sur l’amélioration des capacités industrielles. Soutenue par une plateforme de recherche intégrée et translationnelle couvrant les modèles in vitro et in vivo jusqu’aux études cliniques, notre équipe de recherche interne est maintenant spécialisée dans plus de 15 espèces de nouvelle génération, avec certains candidats intégrés dans le pipeline de découverte. Notre engagement s’étend au dépassement des goulets d’étranglement bien connus, notamment en ce qui concerne les anaérobies stricts sensibles à l’exposition à l’oxygène. Des souches issues de phylums clés, tels que Verrucomicrobiia, Clostridia, Bacteroidetes et Negativicutes, servent de modèles précieux pour les processus innovants.

« En nous appuyant sur l’héritage de nos fondateurs, nous continuons à développer et à étendre le potentiel des probiotiques pour diverses applications dans le domaine de la santé, avec de nouveaux espoirs de comprendre les mécanismes en développant et en utilisant de nouvelles approches combinant de nouvelles souches candidates et de nouveaux outils « , déclare Sylvie Binda, vice-présidente de la recherche et du développement chez Lallemand Health Solutions.

Alors que le paysage du microbiome évolue, Lallemand Health Solutions reste à l’avant-garde de la recherche et du développement.